滿懷期待跑 WB,拍照后卻發(fā)愁了,條帶怎么這么弱?這種時(shí)候,相信很多小伙伴都百思不得其解,除了發(fā)問(wèn)“條帶去哪了”,還一度相信 WB 就是門(mén)玄學(xué)。長(zhǎng)此以往,大家面對(duì) WB 實(shí)驗(yàn)似乎都抱有“心誠(chéng)則靈”的無(wú)力態(tài)度,萬(wàn)一成功了呢?
玩笑歸玩笑,言歸正傳,面對(duì)不好拿下的 WB 實(shí)驗(yàn),“心誠(chéng)則靈”是有道理的。“心誠(chéng)”的意思是,面對(duì)失敗的實(shí)驗(yàn)我們有必要用心逐一排查問(wèn)題所在,優(yōu)化實(shí)驗(yàn)體系??偠灾诜爆崗?fù)雜的 WB 面前,沒(méi)有任何捷徑。
本期的干貨課堂我們就來(lái)重點(diǎn)探討 WB 實(shí)驗(yàn)中的一些關(guān)鍵控制點(diǎn),并提供實(shí)用的 Tips 供大家參考。
WB 實(shí)驗(yàn)步驟
WB 實(shí)驗(yàn)中的關(guān)鍵控制點(diǎn)和注意事項(xiàng)
Key Points about WB
一
WB 樣本的制備
將樣品置于冰上或者維持在 4℃ 下
選擇合適的抑制劑
抑制劑推薦
蛋白酶抑制劑
在細(xì)胞破裂蛋白抽提的過(guò)程中,這些蛋白酶也會(huì)被一起釋放出來(lái),混入蛋白樣品中,對(duì)蛋白樣品造成降解
磷酸酶抑制劑
*(檢測(cè)磷酸化條帶時(shí)必須要添加)
磷酸酶機(jī)理:通過(guò)水解磷酸單酯將底物分子上的磷酸基團(tuán)除去,并生成磷酸根離子和自由的羥基
二
選擇合適的蛋白定量方法
進(jìn)行 Bradford 分析、Lowry 分析或二喹啉甲酸 (BCA) 分析
通常使用牛血清蛋白 (BSA) 作為蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)品
三
WB 電泳分離
用還原及變性的緩沖液 (e.g. Laemmli buffer)將蛋白變性,準(zhǔn)備上樣
使多肽帶上負(fù)電荷
使蛋白變性并將多肽拉直
將二硫鍵打斷
使抗原表位暴露出來(lái)
凝膠上樣
20-40 μg 全細(xì)胞裂解液或 100 ng 純化蛋白
每條泳道上相同蛋白量
根據(jù)目標(biāo)蛋白的表達(dá)量?jī)?yōu)化上樣量
分離膠選擇 Tips(FuturePAGE蛋白預(yù)制膠)
分子量 4-40 kDa,分離膠濃度 20%
分子量 12-45 kDa,分離膠濃度 15%
分子量 10-70 kDa,分離膠濃度 12.5%
分子量 15-100 kDa,分離膠濃度 10%
分子量 25-200 kDa,分離膠濃度 8%
四
WB 的蛋白轉(zhuǎn)膜
電泳結(jié)束后,凝膠(帶有已分離的蛋白)與膜緊貼放置,使用電流把蛋白從凝膠轉(zhuǎn)到膜上。轉(zhuǎn)膜結(jié)束后可用麗春紅進(jìn)行可逆轉(zhuǎn)色判斷轉(zhuǎn)移效果。
膜的類(lèi)型
硝酸纖維素膜(NC 膜),韌性差,低背景
Polyvinylidene Difluoride (PVDF 膜轉(zhuǎn)印包),甲醇激活,蛋白結(jié)合力強(qiáng)
轉(zhuǎn)膜 Tips
對(duì)于分子量較大的靶蛋白,推薦在轉(zhuǎn)膜緩沖液中加入 SDS 至終濃度為 0.1%;對(duì)于分子量較大的靶蛋白,推薦在轉(zhuǎn)膜緩沖液中使用 10% 或者更低濃度的甲醇;對(duì)于分子量較小的靶蛋白,推薦在轉(zhuǎn)膜緩沖液中使用 20% 甲醇
對(duì)于分子量較大的靶標(biāo)蛋白,建議使用 0.45 μm 的 PVDF 膜;對(duì)于分子量較小的靶標(biāo)蛋白,建議使用 0.22 μm 的 PVDF 膜
五
WB 的封閉處理
膜封閉處理可降低一抗/二抗的非特異性結(jié)合。
常用的封閉劑
5% 脫脂奶粉 in TBST
5% BSA in TBST
六
抗體孵育
一抗特異性地檢測(cè)目標(biāo)蛋白
一抗室溫孵育 1-2 h 或 4 ℃ 過(guò)夜孵育
選用適合的一抗工作濃度或稀釋度
一抗可以用封閉液來(lái)稀釋
WB 信
二抗辨認(rèn)一抗的恒定區(qū)
(具有物種特異性)
二抗室溫孵育 1-2 h
選用適合的二抗工作濃度或稀釋度,一般工作濃度要低于一抗
二抗可以用封閉液來(lái)稀釋
二抗帶有標(biāo)簽
七
WB 的信號(hào)檢測(cè)
檢測(cè)方法分為化學(xué)發(fā)光檢測(cè)和熒光檢測(cè)。
號(hào)檢