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干貨 | WB 實(shí)驗(yàn)中的關(guān)鍵控制點(diǎn)和注意事項(xiàng)

欄目:技術(shù)支持
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滿懷期待跑 WB,拍照后卻發(fā)愁了,條帶怎么這么弱?這種時(shí)候,相信很多小伙伴都百思不得其解,除了發(fā)問(wèn)“條帶去哪了”,還一度相信 WB 就是門(mén)玄學(xué)。長(zhǎng)此以往,大家面對(duì) WB 實(shí)驗(yàn)似乎都抱有“心誠(chéng)則靈”的無(wú)力態(tài)度,萬(wàn)一成功了呢?

玩笑歸玩笑,言歸正傳,面對(duì)不好拿下的 WB 實(shí)驗(yàn),“心誠(chéng)則靈”是有道理的。“心誠(chéng)”的意思是,面對(duì)失敗的實(shí)驗(yàn)我們有必要用心逐一排查問(wèn)題所在,優(yōu)化實(shí)驗(yàn)體系??偠灾诜爆崗?fù)雜的 WB 面前,沒(méi)有任何捷徑。

本期的干貨課堂我們就來(lái)重點(diǎn)探討 WB 實(shí)驗(yàn)中的一些關(guān)鍵控制點(diǎn),并提供實(shí)用的 Tips 供大家參考。

WB 實(shí)驗(yàn)步驟


WB 實(shí)驗(yàn)中的關(guān)鍵控制點(diǎn)和注意事項(xiàng)

Key Points about WB


WB 樣本的制備


1

將樣品置于冰上或者維持在 4℃ 下


2

選擇合適的抑制劑


抑制劑推薦


蛋白酶抑制劑

在細(xì)胞破裂蛋白抽提的過(guò)程中,這些蛋白酶也會(huì)被一起釋放出來(lái),混入蛋白樣品中,對(duì)蛋白樣品造成降解



磷酸酶抑制劑

*(檢測(cè)磷酸化條帶時(shí)必須要添加)

磷酸酶機(jī)理:通過(guò)水解磷酸單酯將底物分子上的磷酸基團(tuán)除去,并生成磷酸根離子和自由的羥基

選擇合適的蛋白定量方法


1

進(jìn)行 Bradford 分析、Lowry 分析或二喹啉甲酸 (BCA) 分析


2

通常使用牛血清蛋白 (BSA) 作為蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)品

WB 電泳分離


1

用還原及變性的緩沖液 (e.g. Laemmli buffer)將蛋白變性,準(zhǔn)備上樣

使多肽帶上負(fù)電荷

使蛋白變性并將多肽拉直

將二硫鍵打斷

使抗原表位暴露出來(lái)


2

凝膠上樣

20-40 μg 全細(xì)胞裂解液或 100 ng 純化蛋白

每條泳道上相同蛋白量

根據(jù)目標(biāo)蛋白的表達(dá)量?jī)?yōu)化上樣量


3

分離膠選擇 Tips(FuturePAGE蛋白預(yù)制膠

分子量 4-40 kDa,分離膠濃度 20%

分子量 12-45 kDa,分離膠濃度 15%

分子量 10-70 kDa,分離膠濃度 12.5%

分子量 15-100 kDa,分離膠濃度 10%

分子量 25-200 kDa,分離膠濃度 8%

WB 的蛋白轉(zhuǎn)膜

電泳結(jié)束后,凝膠(帶有已分離的蛋白)與膜緊貼放置,使用電流把蛋白從凝膠轉(zhuǎn)到膜上。轉(zhuǎn)膜結(jié)束后可用麗春紅進(jìn)行可逆轉(zhuǎn)色判斷轉(zhuǎn)移效果。

1

膜的類(lèi)型

硝酸纖維素膜(NC 膜),韌性差,低背景

Polyvinylidene Difluoride (PVDF 膜轉(zhuǎn)印包),甲醇激活,蛋白結(jié)合力強(qiáng)

2

轉(zhuǎn)膜 Tips

對(duì)于分子量較大的靶蛋白,推薦在轉(zhuǎn)膜緩沖液中加入 SDS 至終濃度為 0.1%;對(duì)于分子量較大的靶蛋白,推薦在轉(zhuǎn)膜緩沖液中使用 10% 或者更低濃度的甲醇;對(duì)于分子量較小的靶蛋白,推薦在轉(zhuǎn)膜緩沖液中使用 20% 甲醇

對(duì)于分子量較大的靶標(biāo)蛋白,建議使用 0.45 μm 的 PVDF 膜;對(duì)于分子量較小的靶標(biāo)蛋白,建議使用 0.22 μm 的 PVDF 膜


WB 的封閉處理


膜封閉處理可降低一抗/二抗的非特異性結(jié)合。



常用的封閉劑


5% 脫脂奶粉 in TBST

5% BSA in TBST

抗體孵育


1

一抗特異性地檢測(cè)目標(biāo)蛋白

一抗室溫孵育 1-2 h 或 4 ℃ 過(guò)夜孵育

選用適合的一抗工作濃度或稀釋度

一抗可以用封閉液來(lái)稀釋

WB 信

2

二抗辨認(rèn)一抗的恒定區(qū)

(具有物種特異性)


二抗室溫孵育 1-2 h

選用適合的二抗工作濃度或稀釋度,一般工作濃度要低于一抗

二抗可以用封閉液來(lái)稀釋

二抗帶有標(biāo)簽


WB 的信號(hào)檢測(cè)



檢測(cè)方法分為化學(xué)發(fā)光檢測(cè)和熒光檢測(cè)。


號(hào)檢